最強船長

1位 ルフィ&エース
最大火力が高くキャラチェンジだけでもギミックに対応できる。通常時の火力は高くない（特にエース）ので立ち回りは少し難しいが、火力と対応幅の広さで1位

2位 技ドフィ
編成条件さえ満たしてしまえば立ち回りは非常に簡単。スキルも変えが効かない上に超強い。ただし編成制限がこの中では1番きつい

3位 サボーシー
こちらも立ち回りは超簡単で編成幅も広い。だが、心と知の強敵の相手がしんどい。

4位 知赤犬
追撃ダメージなので、それだけでギミック対応が出来る。一方で編成幅は狭め。また、パーフェクト前提なので1度のタップミスで死ぬ可能性が…

5位 心青雉
船長としては強いけれど、他の4人と比べて特筆するところがない

こんな感じですかね

1位ルフィ&エース, 技ドフィ 3位サボーシー 4位知赤犬 5位心青雉

これまでプレイしてきてコロシアムがまだ襲来ガープの時までは断トツドフィでした。コロシアム、決戦、襲来ガープまで対応してたので。
以降は対策やギミックの多様によりドフィパは野心＋バリア無視(比較的難しい)の規制があるので扱いやすさからランク付けするならば、

サボーシー、ルフィ＆エース、ドフィ、赤犬、青キジかなと思います。
基本船員を選びやすい船長が上位かなと思います。
ここ1年くらいでギミック対策、対応キャラが増え続けていますので。
タップゲーより小学生ぐらいにはちょっと難しいぐらいのアプリになったと配信当初辺りからの凄まじい変化を感じます。